Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc12Q8K2L8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms