Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nek9Q8K1R7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek9Q8K1R7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek9Q8K1R7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek9Q8K1R7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek9Q8K1R7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek9Q8K1R7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nek9Q8K1R7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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