Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sde2Q8K1J5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms