Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms