Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip10Q8CJ53 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms