Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms