Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap29Q8CGF1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap29Q8CGF1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap29Q8CGF1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap29Q8CGF1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap29Q8CGF1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap29Q8CGF1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap29Q8CGF1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap29Q8CGF1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap29Q8CGF1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap29Q8CGF1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap29Q8CGF1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Arhgap29Q8CGF1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms