Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ercc8Q8CFD5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ercc8Q8CFD5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ercc8Q8CFD5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ercc8Q8CFD5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ercc8Q8CFD5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ercc8Q8CFD5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ercc8Q8CFD5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ercc8Q8CFD5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ercc8Q8CFD5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ercc8Q8CFD5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ercc8Q8CFD5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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