Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx8Q8CFD4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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