Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms