Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcinQ8CDE2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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