Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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