Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms