Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn5Q8CBA2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms