Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CntrobQ8CB62 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CntrobQ8CB62 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CntrobQ8CB62 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CntrobQ8CB62 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CntrobQ8CB62 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntrobQ8CB62 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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