Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc159Q8C963 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms