Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CrbnQ8C7D2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms