Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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