Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C1R3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms