Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm16958-202ENSMUST00000181792 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trim35Q8C006 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm45217-201ENSMUST00000206576 1026 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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