Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms