Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Usp38Q8BW70 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp38Q8BW70 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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