Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbrm1Q8BSQ9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms