Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Suds3Q8BR65 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Suds3Q8BR65 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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