Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BPC6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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