Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gga3Q8BMI3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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