Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc2Q8BKV1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc2Q8BKV1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms