Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcal1Q8BJL0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms