Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmd4aQ8BIE6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms