Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf187Q8BFX1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms