Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chn2Q80XD1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms