Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms