Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms