Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sestd1Q80UK0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sestd1Q80UK0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms