Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms