Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap2lQ7TS74 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms