Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms