Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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