Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms