Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HhipQ7TN16 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HhipQ7TN16 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms