Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf139Q7TMV1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf139Q7TMV1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf139Q7TMV1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf139Q7TMV1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf139Q7TMV1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf139Q7TMV1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf139Q7TMV1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf139Q7TMV1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf139Q7TMV1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf139Q7TMV1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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