Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb2aQ7TMM9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms