Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Scn4bQ7M729 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Scn4bQ7M729 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Scn4bQ7M729 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Scn4bQ7M729 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Scn4bQ7M729 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn4bQ7M729 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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