Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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