Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cspg5Q71M36 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cspg5Q71M36 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cspg5Q71M36 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cspg5Q71M36 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cspg5Q71M36 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cspg5Q71M36 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cspg5Q71M36 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cspg5Q71M36 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cspg5Q71M36 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cspg5Q71M36 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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