Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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