Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcp4l1Q6W8Q3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pcp4l1Q6W8Q3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pcp4l1Q6W8Q3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Pcp4l1Q6W8Q3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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