Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc154Q6RUT8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms