Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gapvd1Q6PAR5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gapvd1Q6PAR5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms