Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtminQ6P9S1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtminQ6P9S1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms